农业农村部农业基因组学重点实验室（北京）成立于2011年，是农业基因组学学科群牵头的综合性重点实验室。重点实验室以重要农作物和微生物为研究对象，开展基因组学、代谢组学、表型组学等多组学研究，全面解析重要性状演化规律和调控网络，建立农业生物组学数据中心；设计与合成基因模块和回路，搭建完善的生物组学研究和应用平台；突破合成生物、基因编辑和人工智能育种等前沿引领技术，推进生物组学和生物技术的交叉融合，引领未来基因农业发展方向。
“十三五”以来，承担各类国家科技项目/课题140余项，经费超2.5亿元；发表SCI论文200余篇；获得发明专利100余项、新品种权4项、转基因生物安全证书21项。